业主委员会不能分开成立。依据《物业管理条例》，需满足一定条件才可成立业主大会并选举业委会，分开成立不符合规定。若不及时处理，可能导致小区管理混乱，业主权益受损。
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常见的处理方式是先成立统一的业主大会，再选举业委会。若商铺与住宅有管理差异，可在业主大会内部协商解决方案，如设立分组管理。选择时应考虑小区整体利益和业主需求。
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不能分开成立。操作建议：1.先联合商铺和住宅业主，共同成立业主大会；2.在业主大会中讨论并决定商铺与住宅的管理方式，可设立专门小组负责各自区域；3.若存在分歧，可邀请街道办事处或专业机构调解，确保双方利益得到保障。